Od ždrijela do želuca, jednjak se spušta kroz vrat i medijastinum kao mišićna cijev - duga oko 20-25 cm, prečnika oko 2 cm. Počinje u nivou donje ivice krikoidne hrskavice, prolazi kroz gornji i zadnji medijastinum, zatim kroz jednjakov otvor dijafragme u nivou jedanaestog grudnog pršljena (konvencionalno se navodi deseti; noviji izvori favorizuju jedanaesti), i završava se na kardijalnom ulazu u želudac.

Zid jednjaka čine unutrašnji cirkularni i spoljašnji longitudinalni sloj mišićnih vlakana. Neuobičajeno, tip mišićnog tkiva se mijenja duž dužine organa: u gornjoj trećini je poprečno-prugasta (voljna) muskulatura, u srednjoj trećini mješavina poprečno-prugaste i glatke, a u donjoj trećini isključivo glatka muskulatura.

Osim crvuljastog nastavka, koji je najuža tačka cijelog probavnog trakta, jednjak je sljedeći po tjesnini. Sužen je na više mjesta duž svog toka, mjereno od sjekutića tokom ezofagoskopije: na svom početku, gdje ga obavija m. cricopharyngeus (oko 15 cm od sjekutića); tamo gdje ga sprijeda prelazi luk aorte (oko 23 cm) i lijevi glavni bronh (oko 28 cm); i na mjestu prolaska kroz dijafragmu (oko 40 cm).