Moždano stablo je usko grlo kroz koje mora proći praktično sav saobraćaj između velikog mozga i ostatka tijela - zato mala lezija ovdje, za razliku od jednako male lezije u prostranijem velikom mozgu, često povlači nesrazmjerno tešku i preciznu kliničku sliku.

Opšta građa. Moždano stablo, dugačko oko 6-7,5 cm, leži u zadnjoj lobanjskoj jami, okrenuto naprijed ka clivusu, a pozadi ka malom mozgu i četvrtoj komori. Dijeli se, od kaudalno ka rostralno, na tri segmenta: produženu moždinu (medulla oblongata), most (pons) i srednji mozak (mesencephalon). Svaki od tri segmenta ima trbušni dio (basis, sa silaznim vlaknima) i pokrov (tegmentum, sa jedrima i uzlaznim putevima); samo srednji mozak ima i treći, najdorzalniji dio, krov (tectum). Kroz cijelu dužinu stabla proteže se retikularna formacija, mreža neurona odgovorna za regulaciju svjesnosti, mišićnog tonusa, disanja i rada srca.

Produžena moždina, najkaudalniji i nastavak kičmene moždine, sadrži piramide (silazna kortikospinalna vlakna) razdvojene prednjom medijalnom fisurom, koju kaudalno prekida piramidalna dekusacija - mjesto gdje većina kortikospinalnih vlakana prelazi na suprotnu stranu. Bočno od piramide leži maslinasto ispupčenje (oliva) koje sadrži donje maslinasto jedro. Iz produžene moždine izlaze jezikoglotki (IX), lutajući (X), pomoćni (XI, kranijalni korijen) i podjezični (XII) nerv.

Most, srednji segment, prepoznatljiv je po širokim poprečnim vlaknima na svojoj trbušnoj strani koja se skupljaju u srednji cerebelarni pedunkul i vode ka malom mozgu. Iz mosta izlaze trigeminalni (V, na granici sa srednjim cerebelarnim pedunkulom), abducentni (VI), facijalni (VII) i vestibulokohlearni (VIII) nerv - potonja tri gotovo na spoju mosta i produžene moždine.

Srednji mozak, najkraći i najrostralniji segment (manje od 2 cm), sadrži na trbušnoj strani dva snažna snopa silaznih vlakana (crura cerebri, "kraci mozga") razdvojena interpedunkularnom jamom, a na leđnoj strani četiri ispupčenja krova - gornje kolikuluse (dio vidnog puta) i donje kolikuluse (dio slušnog puta). Crna supstanca (substantia nigra), bogata dopaminergičkim neuronima, i crveno jedro (nucleus ruber) leže u pokrovu srednjeg mozga. Odavde izlaze okulomotorni (III) i trohlearni (IV) nerv.

Jedra kranijalnih nerava organizovana su u uzdužne ćelijske kolone koje odgovaraju embrionalnim porijeklima: motorne kolone (opšta somatska, posebna visceralna, opšta visceralna eferentna) leže medijalnije, senzorne kolone (opšta visceralna, posebna visceralna, opšta somatska, posebna somatska aferentna) bočnije - raspored koji direktno odražava organizaciju bazalne i alarne ploče embrionalne neuralne cijevi.