Kao i kod muškog pola, razvoj ženskog reproduktivnog sistema polazi od iste indiferentne faze: genitalni greben sa primordijalnim germinativnim ćelijama i dva para paralelnih kanala, mezonefrični (Wolfov) i paramezonefrični (Mülerov). Razlika nastaje tek kada, umjesto SRY signala, izostane bilo kakav aktivan indukcioni impuls.

"Podrazumijevani" put razvoja. Za razliku od muškog pravca, koji zahtijeva aktivan signal SRY gena da bi genitalni greben krenuo putem testisa, ženski pravac embriologija opisuje kao "podrazumijevani": u odsustvu tog signala, genitalni greben se razvija u jajnik, a indiferentne strukture prate ženski obrazac razvoja bez posebnog, aktivno pokrenutog "okidača" kakav je SRY kod muškog pola. Ovo je konceptualno važna razlika u odnosu na muški put, gdje je svaki naredni korak, diferencijacija testisa, lučenje AMH, lučenje testosterona, posljedica jednog eksplicitnog signala.

Mülerovi kanali opstaju. Bez testisa nema ni Sertolijevih ćelija ni anti-Mülerovog hormona, pa paramezonefrični (Mülerovi) kanali ne regresiraju nego opstaju i dalje se razvijaju. Gornji dijelovi para kanala ostaju odvojeni i daju jajovode. Donji dijelovi oba kanala se spajaju u srednjoj liniji, formirajući jednu jedinstvenu cijev, iz koje nastaju materica i gornji dio rodnice. Detaljna histološka građa jajnika, jajovoda, materice, grlića i rodnice opisana je na posebnim stranicama.

Wolfovi kanali regresiraju. Bez testosterona, mezonefrični (Wolfovi) kanali, koji bi kod muškog pola opstali i razvili se u epididimis i vas deferens, kod ženskog pola postepeno regresiraju. Ne nestaju u potpunosti: ostavljaju sitne rudimente duž puta kojim su nekad prolazili, kao što su epoophoron pored jajnika i jajovoda i Gartnerov duktus u bočnom zidu rodnice.

Spoljašnja genitalija bez dihidrotestosterona. Isti trojni skup indiferentnih struktura, genitalni tuberkul, uretralni nabori i labioskrotalne izbočine, prati potpuno drugačiju sudbinu u odsustvu dihidrotestosterona. Genitalni tuberkul raste znatno sporije nego kod muškog pola i ostaje malen, formirajući klitoris. Uretralni nabori se, za razliku od muškog pola, ne spajaju: njihovi zadnji krajevi se spoje u frenulum klitorisa, dok ostatak ostaje razdvojen i formira male usne. Labioskrotalne izbočine takođe ostaju razdvojene i formiraju velike usne.