Hipofiza. Sastoji se od dva embriološki potpuno različita dijela, spojena u jednu žlijezdu.

Adenohipofiza je žljezdani dio, epitelnog (ektodermalnog) porijekla, nastaje iz Rathkeove kesice, uzdignuća iz krova primitivne usne duplje. Najveći dio je pars distalis, izgrađena od tračaka i gnijezda sekretornih ćelija, koje se po klasičnom bojenju dijele na acidofilne (ružičaste; somatotropi, koji luče hormon rasta, i laktotropi, koji luče prolaktin), bazofilne (plavo-ljubičaste; tireotropi, gonadotropi i kortikotropi, koji redom luče tireostimulirajući, gonadotropne i adrenokortikotropni hormon) i hromofobne (blijede, slabo obojene, nesekretorne ili degranulisane ćelije). Manji dijelovi adenohipofize su pars tuberalis (uz hipofizno stablo) i pars intermedia (kod čovjeka rudimentaran, tanak sloj). Adenohipofiza nema sopstveno direktno arterijsko snabdijevanje, nego je hormonski upravljana preko hipofiznog portalnog sistema: krv prvo prolazi kroz kapilarni splet u hipotalamusu, gdje pokupi faktore oslobađanja, i tek onda, preko portalnih vena niz hipofizno stablo, stiže do drugog kapilarnog spleta u samoj adenohipofizi.

Neurohipofiza je nervni dio, direktan produžetak hipotalamusa, nema sopstvenih sekretornih ćelija nego se sastoji od aksona neurona čija su tijela u supraoptičkom i paraventrikularnom jedru hipotalamusa. Ovi aksoni transportuju hormone (oksitocin, antidiuretski hormon) do svojih završetaka u neurohipofizi, gdje se nakupljaju u proširenjima zvanim Heringova tjelešca prije nego što se oslobode u krv. Potporne ćelije neurohipofize, pituiciti, su specijalizovana glija, srodna astrocitima.

Epifiza. Mala žlijezda smještena u epitalamusu, izgrađena od tračaka i gnijezda pinealocita, koji luče melatonin, i potpornih glija ćelija nalik astrocitima, koje pružaju strukturnu podršku parenhimu. Karakteristična, dobro poznata osobina epifize su korpora arenacea (takozvani "moždani pijesak"), nakupine kalcifikovanog materijala koje se sa godinama povećavaju u broju i veličini, i vidljive su i na običnom rendgenskom snimku lobanje.