Slezena je najveći sekundarni limfni organ (koštana srž i timus su primarni limfni organi, gdje limfociti nastaju i sazrijevaju), ali za razliku od limfnog čvora filtrira krv, ne limfu. Obavijena je tankom vezivnom kapsulom iz koje polaze trabekule prema unutrašnjosti organa, isti opšti obrazac (kapsula, pa pregrade) kao kod timusa i limfnog čvora.

Bijela pulpa. Limfoidno tkivo slezene, raspoređeno oko centralnih arteriola. Neposredno oko arteriole nalazi se periarteriolarni limfni omotač (PALS), izgrađen pretežno od T limfocita. Uz PALS se nalaze limfni folikuli, nakupine pretežno B limfocita, koji mogu razviti germinativni centar kad su aktivirani.

Crvena pulpa. Čine je venski sinusi i slezinski (Bilrotovi) tračci između njih. Ovdje se odvija filtracija krvi: makrofagi u crvenoj pulpi prepoznaju i uklanjaju stare, oštećene ili abnormalne eritrocite iz cirkulacije.

Marginalna zona. Prelazna zona između bijele i crvene pulpe, bogata makrofagima i posebnim B limfocitima, mjesto gdje krv iz centralne arteriole prvi put dolazi u kontakt sa limfoidnim tkivom, važna za prvi imunski odgovor na antigene u krvi.